Staljeno kovino je treba tudi prečistiti in filtrirati, da se odstranijo škodljiv vodikov plin in nekovinski vključki v kovini, da se izboljša čistost kovine. Rafiniranje običajno uporablja trdna sredstva za rafiniranje ali plinasta sredstva za rafiniranje. Trdna sredstva za rafiniranje na splošno temeljijo na klorovih soli, uporabljajo pa se tudi sredstva za rafiniranje, ki uporabljajo heksakloroetan namesto klorovih soli. V zgodnjih dneh so kot sredstvo za rafiniranje plina uporabljali zelo aktiven plin klor. Čeprav je bil učinek čiščenja dober, je povzročil resno onesnaženje okolja.
Zato so bili razviti mešani plin dušik-klor, inertni plin in sredstvo za rafiniranje treh plinov, ki imajo boljše učinke. Da bi zagotovili učinek rafiniranja, mora biti vsebnost kisika in vlage v plinu za rafiniranje na splošno nižja od 0.03 % oziroma 0,3 g/m3. Metoda dinamičnega vakuumskega odplinjevanja ima tudi dobre učinke razplinjevanja in odstranjevanja natrija.
Filtracija je prehajanje staljene kovine skozi filter iz nevtralnih ali aktivnih materialov, da se odstranijo suspendirani vključki v talini. Steklena mreža, mikroporozne keramične cevi in plošče ter delci aluminijevega oksida se običajno uporabljajo kot filtrirne plasti za filtracijo. Uporabljata se lahko tudi prečiščevanje električnega toka in filtracija plasti toka.